Część kamieni szlachetnych i ozdobnych ma pochodzenie organiczne, niekiedy zachowują swój organiczny charakter bądź też przypominają go tylko swą zewnętrzną formą.

Substancje te wytwarzane są przez organizmy zwierzęce lub roślinne. Odznaczające się podobnie jak mineralne kamienie szlachetne i ozdobne; pięknem tj. barwą, przezroczystością, czystością, intensywnym połyskiem, załamaniem światła, wspaniałymi walorami dekoracyjnymi a także rzadkością występowania.
W Polsce najpopularniejszym kamieniem ozdobnym mającym rodowód organiczny jest bursztyn. Poza nim do najbardziej znanych kamieni jubilerskie pochodzenia organicznego można zaliczyć; gagat, koral, kość słoniową, macica perłową, odontolit, opercelum, perły oraz węgiel kenelski.

